Fenotipat Clínic i Molecular (CMP)

Línia 1. Diagnòstics moleculars relacionats amb la infecció i panells de biomarcadors amfitrió-patogen. Aquesta línia s'ampliarà més enllà dels marcadors derivats de l'amfitrió per incorporar ARN no codificant (ncRNA) derivat del patogen, una àrea innovadora i poc explorada amb un fort potencial translacional. Les prioritats inclouen: i) els miARN virals com a indicadors de la reactivació viral en pacients crítics i amb Long COVID, ii) fragments derivats de l'ARNt per al diagnòstic precoç de l'aspergilosis pulmonar invasiva, i iii) panells combinats d'ARN no codificant (ncARN) d'origen bacterià i de l'amfitrió per orientar la resistència als antimicrobians. Aquestes línies de recerca s'alineen amb els grups de l'ecosistema CIBERES/CIBERINFEC. Quan s'identifiquin senyals sòlids i d'alt impacte en cohorts humans, es duran a terme estudis mecanístics dirigits per enfortir la plausibilitat biològica i, si s'escau, explorar vies d'acció i dianes terapèutiques potencials.
Línia 2. Endotipatge molecular i estratificació de risc en síndromes respiratòries i de cures intensives. El grup desenvoluparà endotips moleculars multinivell per millorar l'estratificació de pacients en malalties respiratòries i síndromes relacionades amb la UCI. Basant-se en cohorts establertes i l'activitat multicèntrica dins del CIBERES (incloent-hi el lideratge en els paquets de treball relacionats amb la Long COVID), el grup identificarà perfils moleculars associats a resultats clínicament rellevants (símptomes persistents, disfunció pulmonar, complicacions) i els traduirà en panells de biomarcadors adequats per a l'avaluació clínica.
Línia 3. Mètodes, reproducibilitat i ciència de la implementació per a biomarcadors d'ARN. El grup liderarà un programa estructurat sobre estandardització i reproducibilitat, ampliant l'activitat internacional de proves en anell en curs cap a un marc de qualitat més ampli per als fluxos de treball d'ARN circulant (variables preanalítiques, extracció/normalització, llindars de notificació i anàlisi de dades). Els lliurables inclouran procediments operatius estàndard harmonitzats i recomanacions de consens vinculades a COST que permetran la comparabilitat entre laboratoris.