Servicios científico técnicos

Bioinformática y Biología Computacional (BIO2COMP)

|Alt Imatge|

Servicio ubicado en el edificio de Biomedicina que ofrece formación, consultoría y análisis en bioinformática y en biología computacional.

Servicios

1.- En Bioinformática

Formación y consultoria

  • Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades bioinformáticas en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior.
  • Formación personalizada y de grupo en Bioinformática y modelización matemática.
  • Asesoría y soporte a los usuarios de herramientas y métodos bioinformáticos.

Análisis estándar

  • Ensamblaje de novo y anotación de genomas procarióticos.
  • Análisis de variantes con genoma de referencia en procariotas y eucariotas.
  • Análisis de expresión genética (MicroArray & RNAseq) para identificación de genes con expresión diferencial.
  • Análisis y optimización de expresión de secuencias biológicas (uso de codones más frecuentes).
  • Modelización y predicción de estructuras de proteínas.
  • Visualización de datos en mapas de redes biológicas.

Análisis especializados

  • Análisis cualitativo y cuantitativo de resultados de experimentos ómicos.
  • Análisis de datos.
  • Otros proyectos no estándar.

2.- En Biología Computacional

Formación y consultoría

  • Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades de biología computacional en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior.
  • Formación personalizada y de grupo en métodos de biología computacional.
  • Asesoría y soporte a los usuarios en la utilización de software de modelización matemática en biología, biomedicina y biotecnología.

Análisis especializados

  • Creación de "digital twins" de procesos biológicos para análisis y optimización de los mismos.
  • Modelos compartimentales.
  • Análisis de sensibilidades y evaluación de escenarios 'what if...' (in silico experiments)

Equipamientos

  • 2 Servidores, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon (24 nodos de computación) a 2.0 GHz, 124 GB RAM, para cálculos intensivos.
  • 4 workstations HP serie Z, con procesadores intel Xeon y 8 nodos de computación.
  • 3 PC de altas prestaciones HP.

Contact details

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Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves

Departamento de Ciencias Médicas Básicas
Facultad de Medicina / Edificio Biomedicina / Laboratorio 4.11
Av. Rovira Roure 80, 25198 Lleida

Web

Equipo

  • Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves

  • Jorge Sebastian Comas Pereyra

  • Alberto Marin Sanguino

  • Albert Sorribas Tello

  • Ester Vilaprinyó Terre